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Ipersensibilità verso la [[neomicina ]] e la [[bacitracina ]] o altri componenti del prodotto; insufficienza renale; sindromi miasteniche; malassorbimento.  I prodotti contenenti neomicina per uso orale sonocontroindicati nei bambini sotto i due anni. Inoltre non si deve somministrare l'antibiotico contemporaneamente ad agenti potenzialmente nefrotossici ([[kanamicina]], [[streptomicina]], [[gentamicina]], [[polimixina]], [[viomicina]], [[colistina]], [[cefalosporine]], ecc.). Occlusione intestinale anche parziale.